Семенные растения разделяются по двум большим группам: покрытосеменные (цветочные растения) и голосеменные (хвойные деревья и кустарники). В случае семенных растений, зародышевая клетка расположена в плодолистиках цветов. После оплодотворения семени пыльцы, зародышевая клетка превращается в семя, внутри плода. У голосеменных, голая зародышевая клетка расположена в чешуйках, образующих шишку. Она превращается в семя после того, как непосредственно оплодотворена семянами пыльцы, находящимися внутри мужских шишок.
Каким бы ни было его происхождение, семя несёт в себе зародыш будущего растения и необходимые питательные запасы для его развития и оно защищено более или менее прочной оболочкой.